Thai Journal of Botany
     
Article's details
 
Title: Patterns of mRNA splicing of Soluble Starch Synthase IVb gene in Thai native rice
ชื่อบทความ: รูปแบบการตัดต่อ mRNA ของยีน Soluble Starch Synthase IVb ในข้าวพื้นเมืองไทย
Author: JARUPUN UNNUNKAT & SIRIPHORN ROTARAYANONT*
ชื่อผู้แต่ง : จารุพรรณ อุ่นนันกาศ และ สิริพร โรจน์อารยานนท์*
Pages: 179 - 189
Year: 2557
Year No.: 6
Volume: พิเศษ   Show All Articles
Abstract:

   ข้าวพื้นเมืองไทยมีความหลากหลายทางพันธุกรรมสูงและมีคุณภาพการหุงต้มหลายระดับ โดยคุณภาพการหุงต้มขึ้นอยู่กับโครงสร้างและอัตราส่วนระหว่างอะไมโลสและอะไมโลเพกทิน สำหรับยีน Soluble Starch Synthase IVb (SSSIVb) เป็นยีนในกลุ่มของเอนไซม์ Soluble Starch Synthase มีบทบาทควบคุมการสร้างอะไมโลเพกทินในเมล็ดข้าว จากการศึกษารูปแบบการตัดต่อ mRNA ของยีน SSSIVb ในเมล็ดข้าวที่กำลังพัฒนาในระยะ 5, 10 และ 15 วัน หลังดอกบานของข้าวพื้นเมืองไทย 8 พันธุ์ ที่มีคุณภาพการหุงต้มแตกต่างกัน พบรูปแบบการตัดต่อ mRNA 3 รูปแบบ ได้แก่ รูปแบบที่ 1 มีการตัด intron ทั้ง 15 ตำแหน่งออกทั้งหมด ตรวจพบในข้าวทุกพันธุ์ รูปแบบที่ 2 ไม่มีการตัด intron 3 ออกจาก mRNA พบในข้าวขาวกระเหรี่ยงและข้าวเล็บ และรูปแบบที่ 3 ไม่มีการตัด intron 3 และ intron 11 ออกจาก mRNA พบในข้าวไอไท้ ข้าวใหญ่ เจ้าเม็ดแง้น ดำหมากมิด พวงมะหวาย และคุณแม่ ทั้งนี้ไม่มีความแตกต่างของรูปแบบการตัดต่อ mRNA ในเมล็ดข้าวที่กำลังพัฒนาทั้งสามระยะหลังดอกบาน และไม่พบความสัมพันธ์กันระหว่างรูปแบบการตัดต่อ mRNA ของยีน SSSIVb กับคุณภาพการหุงต้มของข้าว ทั้งในด้านปริมาณอะไมโลส ความคงตัวของแป้งสุก และอุณหภูมิแป้งสุก

     There is a high genetic diversity and several levels of cooking quality among Thai native rice varieties. The structures and proportions of amylose and amylopectin are the main factors that affect the cooking quality of rice. It is believed that the Soluble Starch Synthase IVb (SSSIVb) gene of the soluble starch synthase could control the synthesis of amylopectin in rice grains. In this study, patterns of mRNA splicing of the SSSIVb gene in developing rice seeds at 5, 10 and 15 days after flowering (DAF), for 8 varieties showing various cooking qualities were examined. It was found 3 different patterns of mRNA splicing of the SSSIVb gene. Pattern I, eliminating all of 15 introns from mRNAs, was detected in all rice samples whilst pattern II with the presence of intron 3 in the mRNAs was observed in Khao Ka Riangand Khao Lep. Moreover, pattern III with the remaining intron 3 and intron 11 in the mRNAs was found in Ai Thai, Khao Yai, Chao Med Ngaen, Dam Mhak Mid, Poung Ma Wai, and Kun Mae. However, there are no observable differences in the patterns of mRNA splicing of SSSIVb gene for the seeds with different DAFs. No relation between the splicing profiles of the SSSIVb gene and cooking quality of rice grains, i.e. amylose content, gel consistency and gelatinization temperature, was found.

 



    right-buttom
     
  Developed By : Plants Database Center
Powered By : QSBG, Thailand